配置するファイルはepsにしてください。

エンコーディングはJPEG-最高画質（低圧縮率）でOKです。品質的にも問題なく、データも軽くすみます。

配置するときはリンクにチェックして下さい。

チェックしないとファイルデーターが大きくなり編集作業にとても時間がかかってしまいます。
埋め込みデータは下記のようなマークが付いています。

ちなみにphotoshop上で中マド状態でクリッピンパスをかけたデータを埋め込むと中マドが反映されません（とんでしまいます。）

●リンク↓

●埋め込み↓

これはイラストレータ8のバグでイラストレータ9以降で解消されています。
ですから当社では配置はリンクを推奨しています。